石地に鎮座する御島石部神社は，「延喜式」所載の「御島石部神社（ミシマイソベ）神社」（三嶋郡六座の一）の論社のひとつである。「式内御島石部神社」を自称する同名の神社が柏崎市北条にもある（→北条の御嶋石部神社）。
当社の起源にまつわる伝承として，かつて大己貴命（大国主命）がこの地を訪れたおり，岩の掛橋が海中から磯辺まで続き，不思議に思い上陸すると，この地の荒神（二田彦，石部彦）が現れて大己貴命を歓待したという。
今，大己貴命が残した剣を御神体として祭っているという。
延々と続く石畳の参道は，寄進によるものである。
拝殿の前に焼き物の狛犬が置かれている。
天保十四年（1843）の棟札が残されており，本殿，幣殿，拝殿とも同時期の建築だと考えられている。
拝殿は，入母屋造，桟瓦葺。向拝部分は細かい装飾で埋められている。
