林神社は，JR（久大本線）豊後国分駅の南南西1.3キロメートルに鎮座する。
社地は富士見が丘の丘陵の北麓で，前に大分川を望む。
敏達天皇（六世紀末）の御代の創立と伝える。
その後，和銅四年（711）に木野社（五十猛命）を合祀して稙田郷の総鎮守となり，後年，稙田，狭間郷十五ケ村から広く崇敬を集めた。
延文四年（1359），天正十四年（1586）の二度の兵火を被った。
明治五年（1872）に西寒田神社の附属社となり，村社に列せられた。大正三年（1914）に下横瀬（田代）の天神社と上横瀬（天神面）の天満社を合祀して現社号に改めた。
「神社明細帳」に記す祭神は「速玉男命，事解男命，木野明神，大物主命，伊弉冉命，五十猛命，金毘羅宮」で，境内の「林神社由緒」に記す祭神は「熊野座神社三柱，伊諾丹命（ママ），五十猛命，崇徳院，大物主命，事解男命，速玉男命，大己眞命（ママ），木野明神，菅原道真公命」で，小異がある。
参道途中の鳥居には，合祀された「天満社」の額束がある。
